MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Periplaneta americana) str. BPLAN plasmid pBPLAN

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013419	AGA	2	6	7	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013419	AGA	2	6	15	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013419	CAT	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013419	A	7	7	54	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013419	TTC	2	6	69	74	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013419	AAC	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013419	A	8	8	107	114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013419	TA	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013419	CATA	2	8	132	139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013419	A	6	6	151	156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013419	CTAC	2	8	161	168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013419	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013419	TC	3	6	187	192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013419	AAT	2	6	211	216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013419	CATA	2	8	264	271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013419	TAA	2	6	282	287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013419	ATC	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013419	AGA	2	6	307	312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013419	T	6	6	324	329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013419	GAA	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013419	T	8	8	364	371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013419	ATC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013419	A	6	6	411	416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013419	T	6	6	445	450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013419	ATTTTT	2	12	462	473	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013419	T	8	8	485	492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013419	CAG	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261599113
28	NC_013419	ATA	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599113
29	NC_013419	GAG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261599113
30	NC_013419	TAAT	2	8	800	807	50 %	50 %	0 %	0 %	261599113
31	NC_013419	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	261599113
32	NC_013419	ATA	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599113
33	NC_013419	GAATG	2	10	883	892	40 %	20 %	40 %	0 %	261599113
34	NC_013419	AAAATA	2	12	926	937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261599114
35	NC_013419	AT	3	6	948	953	50 %	50 %	0 %	0 %	261599114
36	NC_013419	TA	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	261599114
37	NC_013419	ATTTT	2	10	971	980	20 %	80 %	0 %	0 %	261599114
38	NC_013419	CATT	2	8	998	1005	25 %	50 %	0 %	25 %	261599114
39	NC_013419	T	6	6	1032	1037	0 %	100 %	0 %	0 %	261599114
40	NC_013419	ATA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
41	NC_013419	CCT	2	6	1083	1088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261599114
42	NC_013419	T	10	10	1100	1109	0 %	100 %	0 %	0 %	261599114
43	NC_013419	ATCATA	2	12	1141	1152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261599114
44	NC_013419	AAT	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
45	NC_013419	AACTA	2	10	1216	1225	60 %	20 %	0 %	20 %	261599114
46	NC_013419	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599114
47	NC_013419	AT	3	6	1283	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	261599114
48	NC_013419	A	8	8	1300	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	261599114
49	NC_013419	TTA	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599114
50	NC_013419	ACA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599114
51	NC_013419	ATA	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
52	NC_013419	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013419	TTA	3	9	1389	1397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
54	NC_013419	TAT	2	6	1423	1428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
55	NC_013419	AACA	2	8	1450	1457	75 %	0 %	0 %	25 %	261599115
56	NC_013419	TTA	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
57	NC_013419	TTG	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261599115
58	NC_013419	AT	3	6	1582	1587	50 %	50 %	0 %	0 %	261599115
59	NC_013419	TCA	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599115
60	NC_013419	CA	4	8	1705	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	261599115
61	NC_013419	TTCC	2	8	1730	1737	0 %	50 %	0 %	50 %	261599115
62	NC_013419	A	8	8	1769	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	261599115
63	NC_013419	CTCCAT	2	12	1794	1805	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	261599115
64	NC_013419	T	6	6	1862	1867	0 %	100 %	0 %	0 %	261599112
65	NC_013419	T	9	9	1884	1892	0 %	100 %	0 %	0 %	261599112
66	NC_013419	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261599112
67	NC_013419	A	7	7	1978	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
68	NC_013419	TCTG	2	8	1985	1992	0 %	50 %	25 %	25 %	261599112
69	NC_013419	A	7	7	2065	2071	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
70	NC_013419	CT	4	8	2125	2132	0 %	50 %	0 %	50 %	261599112
71	NC_013419	T	6	6	2186	2191	0 %	100 %	0 %	0 %	261599112
72	NC_013419	TTTC	2	8	2232	2239	0 %	75 %	0 %	25 %	261599112
73	NC_013419	A	6	6	2316	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
74	NC_013419	AAAG	2	8	2363	2370	75 %	0 %	25 %	0 %	261599112
75	NC_013419	AGA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261599112
76	NC_013419	AAC	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599112
77	NC_013419	GCT	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261599112
78	NC_013419	CTT	2	6	2432	2437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261599112
79	NC_013419	TAT	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599112
80	NC_013419	CATC	2	8	2481	2488	25 %	25 %	0 %	50 %	261599112
81	NC_013419	CAT	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599112
82	NC_013419	A	6	6	2525	2530	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
83	NC_013419	GCT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261599112
84	NC_013419	CAT	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599112
85	NC_013419	AAT	2	6	2667	2672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599112
86	NC_013419	TTCTGT	2	12	2680	2691	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261599112
87	NC_013419	AT	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	261599112
88	NC_013419	ATTT	2	8	2779	2786	25 %	75 %	0 %	0 %	261599112
89	NC_013419	TTG	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261599112
90	NC_013419	A	6	6	2892	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013419	CG	5	10	2982	2991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013419	TA	3	6	3012	3017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013419	TA	3	6	3024	3029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013419	ATATA	2	10	3036	3045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013419	TAT	3	9	3046	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013419	AT	3	6	3053	3058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013419	A	8	8	3070	3077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013419	GGGGGA	2	12	3103	3114	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013419	T	7	7	3145	3151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013419	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013419	TAT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013419	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013419	A	7	7	3246	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013419	T	7	7	3274	3280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013419	A	7	7	3296	3302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013419	GAA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013419	TTTA	2	8	3333	3340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013419	A	7	7	3346	3352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013419	AAG	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013419	TTGG	2	8	3390	3397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013419	AGT	2	6	3409	3414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.